Молекулярно-генетические характеристики Escherichia coli с продукцией β-лактамаз расширенного спектра, выделенных от больных гемобластозами при цитостатической терапии

Цель исследования – изучить генетическое родство изолятов Escherichia coli с продукцией β-лактамаз расширенного спектра (БЛРС), выделенных со слизистой оболочки кишечника от больных острыми миелоидными лейкозами и лимфомами при первом поступлении в стационар и в процессе цитостатической терапии.
Материалы и методы. В проспективное исследование (2013–2014 гг.) были включены 73 больных (медиана возраста 39 лет), из них 25 больных острыми миелоидными лейкозами и 48 больных лимфомами. Период наблюдения составил 96 дней. Материалом исследования были изоляты E. coli с продукцией БЛРС, выделенные со слизистой оболочки прямой кишки. Детекцию БЛРС проводили фенотипическими методами, генов blaCTX-Mи blaTEM – методом полимеразной цепной реакции, генотипирование – методом ERIC (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus) полимеразной цепной реакции.
Результаты. Изоляты E. coli с продукцией БЛРС были выделены у 39 (53 %) из 73 больных, из них у 12 (16 %) – при первом поступлении, у 27 (37 %) – в период цитостатической терапии. Гены blaCTX-Mбыли определены у 67 % изолятов E. coli, blaTEM – у 41 %, оба гена – у 26 %. Среди 12 БЛРС-положительных E. coli, выделенных при первом поступлении в стационар, не было выявлено генетически родственных изолятов. У 16 (59 %) из 27 изолятов, полученных в процессе пребывания в стационаре, отмечено наличие генетического родства. Генетически родственные изоляты были выделены от больных, находившихся на лечении не только в одном, но и в разных отделениях, и характеризовались наличием как идентичных, так и разных детерминант устойчивости.
Заключение. Исследование доказало возможность передачи изолятов E. coli с продукцией БЛРС, колонизирующих слизистую оболочку кишечника, от одного больного к другому в период их пребывания в стационаре.

1. Клясова Г.А., Охмат В.А. Антимикробная терапия. В кн.: Алгоритмы диагностики и протоколы лечения заболеваний системы крови. Под ред. В.Г. Савченко. М.: Практика, 2018. С. 1067–1113. [Klyasova G.А., Okhmat V.А. Antimicrobial therapy. In: Algorithms of diagnosing and treatment protocols of blood system diseases. Ed.V. G. Savchenko. Moscow: Praktika, 2018. Pр. 1069–1113. (In Russ.)].

2. Biehl L.M., Schmidt-Hieber M., Liss B. et al. Colonization and infection with extended spectrum beta-lactamase producing Enterobacteriaceae in high-risk patients – Review of the literature from a clinical perspective. Crit Rev Microbiol 2016;42(1):1–16. DOI: 10.3109/1040841X. 2013.875515. PMID: 24495097.

3. Охмат В.А., Клясова Г.А., Коробова А.Г. и др. Следует ли назначать карбапенемы всем больным с фебрильной нейтропенией и колонизацией энтеробактериями с продукцией β-лактамаз расширенного спектра? Онкогематология 2016;11(3):49–57. DOI: 10.17650/1818-8346-2016-11-3-49-57. [Okhmat V.A., Klyasova G.A., Korobova A.G. et al. Should to all patients with febrile neutropenia and colonization with extended-spectrum β-lactamaseproducing Enterobacteriaceae carbapenems be appointed? Onkogematologiya = Oncohematology 2016;11(3):49–57. (In Russ.)].

4. Коробова А.Г., Клясова Г.А., Охмат В.А. и др. Колонизация слизистой оболочки кишечника энтеробактериями с продукцией β-лактамаз расширенного спектра при лечении острых миелоидных лейкозов и лимфом. Гематология и трансфузиология 2017;62(3):116–23. DOI: 10.18821/0234-5730-2017-62-3- 116-123. [Korobova A.G., Klyasova G.A., Okhmat V.A. et al. Intestinal colonization with extendedspectrum β-lactamase producing Enterobacteriaceae in patients with acute myeloid leukaemia and lymphoma. Gematologiya i transfusiologiya = Hematology and Transfusiology 2017;62(3):116–23. (In Russ.)].

5. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам (Методические указания МУК 4.21890–04). Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2004;6:306–59. [Guidelines for Susceptibility testing of microorganisms to antibacterial agents. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy 2004;6:306–59. (In Russ.)].

6. Versalovic J., Koeuth T., Lupski J.R. Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes. Nucleic Acids Res 1991;19(24):6823–31. PMID: 1762913.

7. Heras J., Domínguez C., Mata E. et al. GelJ – a tool for analyzing DNA fingerprint gel images. BMC Bioinformatics 2015;16:270. DOI: 10.1186/s12859-015-0703-0. PMID: 26307353.

8. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. J Clin Microbiol 1988;26(11):2465–6. PMID: 3069867.

9. Программное лечение заболеваний системы крови: Сборник алгоритмов диагностики и протоколов лечения заболеваний системы крови. Под ред. В.Г. Савченко. М.: Практика, 2012. 1056 с. [Program treatment of blood system diseases. Collection of diagnostic algorithms and treatment protocols of blood system diseases. Ed.V. G. Savchenko. Moscow: Praktika, 2012. 1056 p. (In Russ.)].

10. Calatayud L., Arnan M., Liñares J. et al. Prospective study of fecal colonization by extended-spectrum-beta-lactamaseproducing Escherichia coli in neutropenic patients with cancer. Antimicrob Agents Chemother 2008;52(11):4187–90. DOI: 10.1128/AAC. 00367–08. PMID: 18809942.

11. Прямчук С.Д., Фурсова Н.К., Абаев И.В. и др. Генетические детерминанты устойчивости к антибактериальным средствам в нозокомиальных штаммах Escherichia coli, Klebsiella spp. и Enterobacter spp., выделенных в России в 2003–2007 гг. Антибиотики и химиотерапия 2010;55(9–10):3–10. [Pryamchuk S.D., Fursova N.K., Abaev I.V. et al. Genetic determinants of antibacterial resistance among nosocomial Escherichia coli, Klebsiella spp., and Enterobacter spp. Isolates collected in Russia within 2003–2007. Antibiotiki i chimiotherapiya = Antibiotics and Chemotherapy 2010;55(9–10):3–10. (In Russ.)].

12. Bevan E.R., Jones A.M., Hawkey P.M. Global epidemiology of CTX-M β-lactamases: temporal and geographical shifts in genotype. J Antimicrob Chemother 2017;72(8):2145–55. DOI: 10.1093/jac/dkx146. PMID: 28541467.

13. Titelman E., Hasan C.M., Iversen A. et al. Faecal carriage of extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae is common 12 months after infection and is related to strain factor. Clinical Microbiol Infect 2014;20(8):O508–15. DOI: 10.1111/1469-0691.12559. PMID: 24450760.

14. Tschudin-Sutter S., Frei R., Dangel M. et al. Rate of transmission of extendedspectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae without contact isolation. Clin Infect Dis 2012;55(11): 1505–11. DOI: 10.1093/cid/cis770. PMID: 22955436.

15. Apisarnthanarak A., Kiratisin P., Mundy L.M. Clinical and molecular epidemiology of healthcare-associated infections due to extended-spectrum betalactamase (ESBL) – producing strains of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae that harbor multiple ESBL genes. Infect Control Hosp Epidemiol 2008;29(11):1026–34. DOI: 10.1086/591864. PMID: 18947321.

16. Tacconelli E., Cataldo M.A., Dancer S.J. et al. ESCMID guidelines for the management of the infection control measures to reduce transmission of multidrug-resistant Gram-negative bacteria in hospitalized patients. Clin Microbiol Infect 2014;20(Suppl. 1):1–55. DOI: 10.1111/1469–0691.12427. PMID: 24329732.

17. Zahar J.R., Poirel L., Dupont C. et al. About the usefulness of contact precautions for carriers of extended spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli. BMC Infect Dis 2015;15:512. DOI: 10.1186/s12879-015-1244-x. PMID: 26563141.

18. Jarlier V., Trystram D., Brun-Buisson C. et al. Curbing methicillin-resistant Staphylococcus aureus in 38 French hospitals through a 15-year institutional control program. Arch Intern Med 2010;170(6):552–9. DOI: 10.1001/archinternmed.2010.32. PMID: 20308642.

19. Aumeran C., Baud O., Lesens O. et al. Successful control of a hospital-wide vancomycin-resistant Enterococcus faecium outbreak in France. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2008;27(11):1061–4. DOI: 10.1007/s10096-008-0544-0. PMID: 18612668.

20. Gaillot O., Maruéjouls C., Abachin É. et al. Nosocomial outbreak of Klebsiella pneumoniae producing SHV-5 extendedspectrum β-lactamase, originating from a contaminated ultrasonography coupling gel. J Clin Microbiol 1998;36(95):1357–60. PMID: 9574705.