Количественный анализ химеризма после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток молекулярно-генетическими методами

Количественный мониторинг химеризма после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток молекулярными методами стал обязательным диагностическим инструментом для определения степени приживления трансплантата или его отторжения, а также предсказания рецидива основного заболевания. Несмотря на широкое применение анализа химеризма, до сих пор вызывает дискуссию выбор стандартного количественного лабораторного метода для его рутинного использования. В данном исследовании мы сравнили 2 молекулярных метода определения гемопоэтического химеризма: мультиплексную полимеразную цепную реакцию коротких тандемных повторов (STR-ПЦР) с последующим фрагментным анализом и амплификацию полиморфизмов инсерция / делеция с использованием полимеразной цепной реакции в реальном времени (InDel-ПЦР). Мы выполнили исследование химеризма у 60 пациентов с помощью STR-ПЦР и InDel-ПЦР. Для всех пар донор / реципиент были обнаружены информативные STR-аллели (100 %), тогда как информативные аллели для реципиента методом InDel-ПЦР – только в 88 % пар. Чувствительность STR-ПЦР и InDel-ПЦР составила 1–5 % и более 0,01 % соответственно. Точность определения количества была выше для STR-PCR, чем для InDel-PCR, при уровне донорского химеризма 3–97 %. Таким образом, наиболее оптимальным подходом для мониторинга гемопоэтического химеризма у пациентов с уровнем химеризма менее 5 % или более 95 % является использование InDel-ПЦР, а при уровне химеризма 5–95 % для мониторинга рекомендуется использование STR-PCR.

1. Lion F., Watzinger S., Preuner H. et al. The EuroChimerism concept for a standardized approach to chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation. Leukemia 2012;26(8):1821–8.

2. Antin J. H., Childs R., Filipovich A. H. et al. Establishment of complete and mixed donor chimerism after allogeneic lymphohematopoietic transplantation: Recommendations from a workshop at the 2001 tandem meetings of the international bone marrow transplant registry and the American society of blood and marrow transplantation. Biol Bone Marrow Transplant 2001;7(9):473–85.

3. Чухловин А. Б., Фезе Б., Зарайский М. И. и др. Принципы молекулярно-генетической оценки гемопоэтического химеризма и области его применения в гематологии. Вопр гематол / онкол и иммунопатол в педиатрии 2002;1(l):70–4.

4. Jiménez-Velasco А., Barrios М., Roman- Gomez J. et al. Reliable quantification of hematopoietic chimerism after allogeneic transplantation for acute leukemia using amplification by real-time PCR of null alleles and insertion / deletion polymorphism. Leukemia 2005; 19(3):336–43.

5. Kristt D., Stein J., Yaniv I. et al. Assessing quantitative chimerism longitudinally: technical considerations, clinical applications and routine feasibility. Bone Marrow Transplantat 2007;39(5):255–68.

6. Khan F., Agarwal A. and Agrawal S. Significance of chimerism in hematopoietic stem cell transplantation: new variations on an old theme. Bone Marrow Transplant 2004;34(1):1–12.

7. Alizadeh M., Bernard M., Danic B. et al. Quantitative assessment of hematopoietic chimerism after bone marrow transplantation by real-time quantitative polymerase chain reaction. Blood 2002;99(12):4618–25.

8. Rodriguez-Murillo L. and Salem R. M. Insertion / Deletion Polymorphism. In M. D. Gellman & J. R. Turner (eds.). Encyclopedia of behavioral medicine. New York: Springer, 2013; part 16:1076.

9. Koldehoff M., Steckel N. K., Hlinka M. et al. Quantitative analysis of chimerism after allogeneic stem cell transplantation by realtime polymerase chain reaction with single nucleotide polymorphisms, standard tandem repeats, and Y-chromosome-specific sequences. Am J Hematol 2006;81(10):735–46.

10. van Dongen J. J., Macintyre E. A., Gabert J. A. et al. Standardized RT-PCR analysis of fusion gene transcripts from chromosome aberrations in acute leukemia for detection of minimal residual disease. Report of the BIOMED-1 Concerted Action: investigation of minimal residual disease in acute leukemia. Leukemia1999;13(12):1901–28.

11. Kristt D., Israeli M., Narinski R. et al. Hematopoietic chimerism monitoring based on STRs: quantitative platform performance on sequential samples. J Biomolecular Techniques 2005;16(4);378–89.

12. Bland J. M., Altman D. G. Statistical methods for assessing agreement between two methods of clinical measurement. Lancet 1986;327(8476):307–10.

13. Hanneman S. K. Design, analysis, and interpretation of method-comparison studies. AACN Adv Crit Care 2008;19(2):223–34.